Persiapan untuk serangan baru terhadap Neuroi—ras misterius penyerbu alien—sedang berlangsung. Tujuannya adalah mengamankan Berlin, ibu kota Kekaisaran Karlsland, yang diperlukan untuk memusnahkan ancaman Neuroi dari Eropa. Namun, karena musuh mampu beradaptasi di medan perang setiap hari, pasukan sekutu dan kondisi teknologi Striker saat ini mungkin tidak cukup untuk mencapai kemenangan.
Sementara itu, Yoshika Miyafuji, seorang Penyihir dari Fuso, melanjutkan studi kedokterannya di Lausanne. Setelah pulih dari insiden baru-baru ini yang merampas kekuatan magisnya, dia sangat ingin membantu dalam upaya perang. Panggilan untuk senjata segera tiba dan para penyihir yang tersebar dari Sayap Tempur Gabungan ke-501 harus dikumpulkan sekali lagi untuk dorongan terakhir melawan musuh.